Em 1469, por ordens do Infante Don Henrique, tomou Manuel Afonso Sanha (escudeiro de Dom Fernando) terras de sesmaria neste lugar, nelas mandando edificar uma ermida dedicada ao Senhor Bom Jesus, cuja construção é anterior a 1507. Esta devoção, muito antiga, terá surgido nesta ilha desde 1466 com o dito sesmeiro, colono oriundo de Braga e que para a sua sesmaria na Ponta Delgada fez transplantar o seu patrono. Neste templo se estabeleceu a sede da paróquia, criada que foi no ano de 1550.